MLDonkey fue originalmente pensada como un clon de eDonkey2000 puro, que se ejecutan en Unix y Linux, un sector en el que el cliente original nunca sirvió bien. Desde el lanzamiento de la versión 2, también ha habido desarrollo para acceder a otras redes (véase OtherNetworksSupported), más notablemente en la descendencia de eDonkey2000 Overnet.
La historia de MLDonkey ha sido forrada de controversia, principalmente basado en el hecho que el cliente original siempre ha sido propietario, en términos de código de fuente, así como transferencia de protocolo. Esto ha obligado a los desarrolladores de MLDonkey a ingeniería inversa los mecanismos básicos, pero no se detienen en ese.En muchos casos, la nueva funcionalidad ha sido introducida, a veces de gran y a veces cuestionable.
MLDonkey introdujo un método para conectarse a varios servidores de forma simultánea, incrementando la eficiencia de búsqueda enormemente. ?Esto fue en un momento cuando los servidores eran muy pequeñas y ya tensa (principalmente por bots). Demasiados usuarios, unos pocos servidores, nuevas soluciones que necesitan.
Más tarde algunos administradores de servidor pretencioso se interesan cada vez más en los números de usuarios asignados a sus servidores, en lugar de hacerlo en la eficiencia de la red. Esto significa que un cliente que se conecta a más de un servidor fue una amenaza para sus internas "alta puntuación" competencia de usuarios servidos.
Quejas comenzaron a proceden los usuarios de eDonkey sobre MLDonkey siendo demasiado eficiente, es decir, utilizando una cantidad injusta de los recursos de red. Esto probablemente tiene que ver con la renuencia extrema de los desarrolladores de eDonkey2000 para mejorar su producto, lo que llevó a servidores más y más grandes, en lugar de seguir el enfoque representaba MLDonkey: aumentar la conectividad de la red como un todo.Pero, de nuevo, hacer que la red eDonkey2000 demasiado eficientes probablemente no sería en consonancia con los planes para desarrollar el Overnet, que es de hecho una alta conectividad red sin servidor.
MLDonkey también cuenta con una forma de fuentes de archivo entre clientes, con lo que a los servidores menos importante, por supuesto otra amenaza para el orgullo de los administradores de servidor de exchange.Pronto, una extraña alianza fue formada por el desarrollador del popular servidor de Lugdunum y MetaMachine, la compañía de desarrollo de eDonkey2000.Esto dio lugar a una larga serie de intentos para prohibir MLDonkey, prohibiciones que fueron fácilmente trabajó alrededor y debido a la naturaleza de los proyectos de código abierto, también fácil de implementar entre los usuarios.